超微量研究科技中心針對新興化學物質進行一系列之方法開發，因不當的化學品管制而流布至空氣、土壤和放流水等環境中，故開發不同環境介質採集方式搭配檢測技術，本中心已建置多項環境持久性有機物、環境荷爾蒙分析技術：戴奧辛類化合物(如戴奧辛、多氯聯苯及多溴二苯醚)、塑化劑、壬基酚、雙酚A、農藥等，惟仍有部分管制物種分析技術尚未完善，將持續開發毒物與關注化學物質檢驗、有害空氣污染物質檢驗和新興污染物檢驗。已開發檢驗技術項目包含:水質水量類(有機磷農藥和氰化物)、飼料類(戴奧辛、戴奧辛類多氯聯苯)、食品類(戴奧辛、戴奧辛類多氯聯苯和非戴奧辛類多氯聯苯)、血液中戴奧辛、植物中戴奧辛、飲用水類(氰化物)和地下水類(氰化物)。本中心亦取得水中殘留農藥檢測方法－液相層析/串聯式質譜儀法 (NIEA W603.50B)方法之完整項目認證，可用此方法檢測總有機磷劑29項、除草劑2項和總氨基甲酸鹽9項，為台灣惟二的檢測機構。